A finals de mar\u00e7 investigadors de Vall d’Hebron han seq\u00fcenciat el genoma del virus SARS-CoV-2 de dos pacients.\u00a0El que havia de ser un projecte d’un any de durada, es va convertir en una carrera a contrarellotge per aturar la pand\u00e8mia del SARS-CoV-2. En quinze dies, el grup de recerca en Malalties Hep\u00e0tiques del Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR) amb una \u00e0mplia expertesa en t\u00e8cniques de seq\u00fcenciaci\u00f3 massiva, i la Unitat de Virus Respiratoris del Servei de Microbiologia de l\u2019Hospital Universitari Vall d’Hebron, seq\u00fcenciaven el genoma complet de dues soques del SARS-CoV-2 de dos pacients.<\/p>\n
El <\/span>treball ha estat el resultat de l\u2019estreta col\u00b7laboraci\u00f3 entre<\/span> la Unitat de Virus Respiratoris del Servei de Microbiologia de l\u2019Hospital Universitari Vall d’Hebron i el grup de recerca en Malalties Hep\u00e0tiques del Vall d’Hebron Institut de Recerca.<\/span><\/p>\n Parlem sobre la utilitat de la recerca, sobre compartir coneixements, sobre la col\u00b7laboraci\u00f3 entre grups i sobre com ha canviat el dia a dia dels investigadors cient\u00edfics. Ho fem amb Damir Garcia Cehic, labmanager del grup de recerca en Malalties Hep\u00e0tiques del Vall d’Hebron Institut de Recerca.<\/p>\n En totes les professions que poden aportar alguna cosa a la crisi pel coronavirus els horaris han desaparegut<\/strong><\/p>\n S\u00ed. Jo m’aixeco al mat\u00ed i ja no s\u00e9 si \u00e9s dimarts, dimecres o on estem.<\/p>\n Com \u00e9s el vostre dia a dia i com veu decidir la col\u00b7laboraci\u00f3?<\/strong><\/p>\n La jornada laboral a la qual est\u00e0vem acostumats ja no la tenim. Passem aqu\u00ed el temps que faci falta i si hem de venir un dissabte o un diumenge, ho fem.<\/span><\/p>\n Jo treballo com lab manager del laboratori d’Hepatitis virals de l’Institut de Recerca de l’Hospital Univeritari Vall d’Hebron i ara estem col\u00b7laborant amb el Departament de Microbiologia de Vall d’Hebron, concretament en el grup de virus respiratoris. Nosaltres ja ten\u00edem molta experi\u00e8ncia acumulada d’haver treballat molts anys amb el virus de l’Hepatitis C i ten\u00edem coneixement de seq\u00fcenciaci\u00f3.<\/p>\n La col\u00b7laboraci\u00f3 era per combinar coneixements. Ells amb els virus respiratoris i nosaltres amb l’aportaci\u00f3 d’haver seq\u00fcenciat ja abans i totes les metodologies que hav\u00edem posat a punt fins avui.<\/p>\n La gr\u00e0cia, en un idioma que entengui tothom, de seq\u00fcenciar els virus, quina \u00e9s? Quin \u00e9s l’objectiu?<\/strong><\/p>\n Ara nosaltres part\u00edem d’una base zero amb la COVID-19. Ha sigut iniciar tot l’estudi per\u00f2 tamb\u00e9 provar noves metodologies que per molt que tingu\u00e9ssim avan\u00e7ades per altres estudis, amb la COVID-19 no ten\u00edem una base on agafar-nos i comen\u00e7ar a estirar del fil.<\/p>\n Vam decidir que l’an\u00e0lisi del genoma complet seria la base. A partir d’aqu\u00ed, un cop ja tingu\u00e9ssim el genoma complet ben analitzat, ja podr\u00edem agafar i pensar quines estrat\u00e8gies, quin \u00fas li pots donar i com pots continuar a partir d’aqu\u00ed.<\/p>\n Els vostres resultats poden servir per a altres recerques que s’estan fent amb l’objectiu d’aturar la transmissi\u00f3 o trobar vacunes per exemple?<\/strong><\/p>\n El que \u00e9s important no \u00e9s el qu\u00e8 un grup pugui fer o deixar de fer, sin\u00f3 la cooperaci\u00f3 i la col\u00b7laboraci\u00f3. Nosaltres al final estem treballant a Vall d’Hebron per\u00f2 hem de crear sinergies m\u00e9s enll\u00e0 i buscar col\u00b7laboracions entre grups de recerca de diferents zones. Si el que nosaltres estem fent com equip i puguem descobrir, serveix per un altre grup amb unes l\u00ednies totalment diferents com podria ser la recerca de vacunes, doncs genial.<\/p>\n Si nosaltres amb l’an\u00e0lisi del genoma del virus aconseguim per exemple trobar una regi\u00f3 interessant, que tingui una variabilitat molt baixa, que sigui sempre igual en tots els casos que tenim analitzats… Doncs aix\u00f2 en un grup que tingui m\u00e9s experi\u00e8ncia en el disseny de vacunes els hi pot servir per col\u00b7locar-li la seva diana. Els hi donar\u00edem informaci\u00f3 interessant d’on anar a buscar.<\/p>\n Tamb\u00e9 ens pot servir per trobar marcadors que tamb\u00e9 ens donin algun tipus de predicci\u00f3. En els primers dies de la infecci\u00f3 potser es trobava algun marcador i gr\u00e0cies a poder analitzar les mostres, podr\u00edem haver trobat informaci\u00f3 d’una posici\u00f3 o marcador que ens indiqui pacients lleus i aix\u00ed poder diferenciar aquests d’alg\u00fa que pugui tenir una infecci\u00f3 aguda.<\/p>\n S\u00f3n idees d’elements que podem anar trobant perqu\u00e8 evidentment hi ha molts m\u00e9s factors que el virus en si. Tots tenim la nostra gen\u00e8tica i el nostre propi sistema immune.<\/p>\n Clar, s\u00f3n factors que van m\u00e9s enll\u00e0 del comportament del virus<\/strong><\/p>\n Exacte. \u00c9s una feina molt complexa.<\/p>\n Tamb\u00e9 hi ha el tema de les mutacions, que no podeu preveure totalment<\/strong><\/p>\n Hem de pensar que \u00e9s un virus totalment nou. L’Hospital Carlos III de Madrid tamb\u00e9 t\u00e9 molta experi\u00e8ncia en virus respiratoris i ja tenien un punt de partida per fer l’an\u00e0lisi i per saber per on havien d’anar. Per\u00f2 en tot el tema de les mutacions, el volum d’informaci\u00f3 que necessites \u00e9s molt gran. I mira que ara tothom est\u00e0 compartint-la.<\/p>\n A Val\u00e8ncia van aconseguir seq\u00fc\u00e8ncies parcials del genoma, aqu\u00ed al Trias i Pujol tamb\u00e9 han penjat algunes seq\u00fc\u00e8ncies que estan quasi completes, al Carlos III tamb\u00e9… Tothom est\u00e0 compartint i al final \u00e9s la millor estrat\u00e8gia. Que tothom col\u00b7labori donant la m\u00e0xima informaci\u00f3 perqu\u00e8 aconseguim trobar com a m\u00ednim informaci\u00f3 \u00fatil. Dir que \u00e9s per trobar una soluci\u00f3 no ho puc dir, que \u00e9s molt agosarat, per\u00f2 s\u00ed informaci\u00f3 \u00fatil per poder trobar-li una aplicaci\u00f3 en la cl\u00ednica, en el dia a dia dels hospitals.<\/p>\n Al final \u00e9s el treball de molt\u00edssima gent. No ser\u00e0 un sol grup, ni un sol equip de recerca qui aporti. Ser\u00e0 una xarxa de col\u00b7laboracions on tothom haur\u00e0 aportat el seu petit gra de sorra per acabar traient alguna cosa en positiu de tota la investigaci\u00f3 que s’est\u00e0 fent, que anem treballant al 200%.<\/p>\n I ja no \u00e9s nom\u00e9s la part de recerca, tamb\u00e9 tota la gent que est\u00e0 treballant a la part assistencial: els t\u00e8cnics que estan a la part de diagn\u00f2stic, no a recerca, s\u00f3n gent que ha respost de manera excel\u00b7lent. Ens veiem cada dia, perqu\u00e8 tinc la sort de poder intentar ajudar des del laboratori d’un hospital i realment \u00e9s admirable el qu\u00e8 estan arribant a fer.<\/p>\n Tamb\u00e9 han duplicat la feina perqu\u00e8 arriben m\u00e9s proves<\/strong><\/p>\n S\u00ed. \u00c9s un degoteig constant. \u00c9s arribar al mat\u00ed, posar-se la bata i no parar. Hi ha pics de feina brutals. Al final veure com s’est\u00e0 gestionant i com s’est\u00e0 organitzant aporta molt. Per mi, l’experi\u00e8ncia de treballar aqu\u00ed a l’Hospital Vall d’Hebron \u00e9s excepcional. A ning\u00fa se li pot retreure absolutament res. Des del t\u00e8cnic de diagn\u00f2stic passant per tots els estaments: tota la gent de l’hospital ja sigui neteja, el servei de menjador… tothom est\u00e0 implicat al 200%. I realment t’omple molt aquests dies ser aqu\u00ed. Si has de venir i estar 12 o 14 hores treballant no ho vius com un sacrifici i no penses ‘avui he treballat 14 hores’. Jo hi ha dies que marxo amb ganes de dormir i aixecar-me per tornar a ser aqu\u00ed.<\/p>\n Ho vius com una superaci\u00f3, doncs<\/strong><\/p>\n Si estiguessis sol, potser seria desmotivant per\u00f2 al final \u00e9s una q\u00fcesti\u00f3 d’actitud: venir a treballar i d’estar tots remant en la mateixa direcci\u00f3. I clar, jo si s\u00e9 fer una cosa i cal fer-la, no em puc quedar a casa.<\/p>\n Algun dia descansareu per\u00f2<\/strong><\/p>\n S\u00ed. Els dies que ens quedem a casa \u00e9s perqu\u00e8 en alguns casos els seq\u00fcenciadors triguen X dies a donar resultats i si estan tots en marxa, tampoc pots fer massa m\u00e9s que esperar els resultats. I aquests s\u00f3n els dies que ens estem marcant com a descans. Potser coincideix que \u00e9s un dimecres aix\u00f2.<\/p>\n Si hem de venir un diumenge a la tarda per avan\u00e7ar feina, venim i ja descansarem dimarts. La sensaci\u00f3 que hi ha en aquest hospital vagi’s on vagi’s no \u00e9s de sacrifici ni d’ofec, sin\u00f3 tot el contrari.<\/p>\n Fora del dramatisme de la situaci\u00f3, com a investigadors ha de tenir una part molt interessant poder estar dins un projecte aix\u00ed<\/strong><\/p>\n S\u00ed. \u00c9s una motivaci\u00f3 pels grups de recerca el fet de poder ser part\u00edcips i poder col\u00b7laborar. Es pot arribar a pensar equivocadament que vulguem treure articles o el m\u00e0xim profit per aconseguir algun altre projecte o finan\u00e7ament, per\u00f2 el qu\u00e8 m\u00e9s ens omple al cap i a la fi, des del grup d’Hepatitis com a m\u00ednim, \u00e9s que la investigaci\u00f3 que puguis fer despr\u00e9s tingui una aplicabilitat cl\u00ednica o una utilitat.<\/p>\n Que estiguis 10 anys treballant en alguna cosa i que despr\u00e9s aix\u00f2 on has estat treballant tingui un \u00fas i se li doni un bon \u00fas i sigui \u00fatil en un hospital per ajudar a la gent… Aix\u00f2 \u00e9s el que t’acaba omplint m\u00e9s i el que t’acaba motivant m\u00e9s per venir aqu\u00ed.<\/p>\n La investigaci\u00f3 est\u00e0 en la situaci\u00f3 on est\u00e0 en aquest pa\u00eds… el que ens compensa \u00e9s el punt de satisfacci\u00f3 personal, la il\u00b7lusi\u00f3 que et fa treballar aqu\u00ed, que t’agrada la teva feina i que se’t retorna tota la feina que est\u00e0s fent quan aconsegueixes fer alguna cosa que serveixi per ajudar. Tots els qui ens dediquem a investigaci\u00f3 b\u00e0sica et dirien les mateixes paraules.<\/p>\n Comentes que ara esteu compartint coneixements per\u00f2 de normal les publicacions no estan en obert. Creus que canviar\u00e0 la pol\u00edtica de privacitat de les revistes?\u00a0<\/strong><\/p>\n No en tinc ni idea… Que tothom pugui tenir acc\u00e9s a all\u00f2 que es fa \u00e9s un tema molt complex… Podria dir-te que tant de bo tot estigu\u00e9s obert i tothom pogu\u00e9s accedir a la informaci\u00f3 fiable i verificada per\u00f2 s\u00f3n temes que no em corresponen molt i no ho puc saber.<\/p>\n A part, situacions com aquesta al cap i a la fi ja existeixen. Hi ha xarxes de col\u00b7laboraci\u00f3 a nivell estatal des de fa molts anys entre centres. Situacions com aquestes s\u00f3n el que m\u00e9s valor donen: compartir i no nom\u00e9s amb grups o laboratoris del mateix centre i que tothom acabi aportant l’experi\u00e8ncia que t\u00e9 en els seus \u00e0mbits<\/p>\n La majoria de gent que esteu treballant amb la COVID-19, si b\u00e9 no veniu tots del m\u00f3n respiratori, s\u00ed que veniu del m\u00f3n dels virus: vosaltres des de l’Hepatitis C, el projecte del Dr. Bonaventura Clotet ve del VIH…<\/strong><\/p>\n Exacte. I s\u00ed per\u00f2 cal ser conscients que al final tots els virus s\u00f3n diferents. Nosaltres hem entrat a col\u00b7laborar amb ells sobretot per l’experi\u00e8ncia metodol\u00f2gica perqu\u00e8 els virus s\u00f3n totalment diferents. Estem en moments d’assaig-errors i estem encara fent modificacions.<\/p>\n Vam arribar a seq\u00fcenciar dos pacients sencers per\u00f2 per aconseguir aix\u00f2 hem hagut de fer molta feina. Hem hagut de provar moltes metodologies diferents i portar en paral\u00b7lel moltes t\u00e8cniques diferents. L’important d’aix\u00f2 ha estat trobar la metodologia m\u00e9s que trobar la seq\u00fc\u00e8ncia que ja \u00e9s prou per trobar un punt de partida.<\/p>\n Aquesta fase ja l’hem passat i ara anem tenint-ho tot m\u00e9s preparat. Els experiments i el que fem a partir d’aquest punt esperem que vagin sortint amb m\u00e9s agilitat. Tot \u00e9s molt sensible. Hi ha tanta gent i tants estaments implicats… I hi ha preguntes que no es poden contestar.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" A finals de mar\u00e7 investigadors de Vall d’Hebron han seq\u00fcenciat el genoma del virus SARS-CoV-2 de dos pacients.\u00a0El que havia de ser un projecte d’un any de durada, es va convertir en una carrera a contrarellotge per aturar la pand\u00e8mia del SARS-CoV-2. En quinze dies, el grup de recerca en Malalties Hep\u00e0tiques del Vall d’Hebron […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":22083,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[8],"tags":[2152],"class_list":["post-22082","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-recerca","tag-coronavirus"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/22082","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=22082"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/22082\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=22082"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=22082"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/amazing-bassi.82-223-8-23.plesk.page\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=22082"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}